血液样本：这是最传统的亲子鉴定样本之一。血液中含有丰富的DNA信息，通过抽取静脉血即可获取足够的DNA量进行检测。由于其高准确性和相对稳定性，血液样本一直是亲子鉴定中的“黄先进准”。然而，采血过程需要专业人员操作，且对被采样者有一定的侵入性，因此在实际应用中可能受限。
口腔黏膜细胞：采集方式简单非侵入性，通过使用专用棉签在口腔内壁轻轻刮取，即可获得大量脱落的口腔黏膜上皮细胞，这些细胞同样携带完整的DNA信息。因其采集过程微痛且易于操作，特别适合于儿童或对采血有顾虑的人群。但需注意，采集前应确保被采样者空腹状态，并避免近期食用刺激性食物，以防污染样本。
头发与毛发：头发也是常用的亲子鉴定样本之一，尤其是带有完整毛囊的头发，因为毛囊中富含DNA。需要注意的是，自然脱落的头发往往因DNA降解而难以提取有效信息，剪下的头发则几乎不含可用DNA。因此，采集时应尽量选择拔取的方式，并连同根部毛囊一起送检。
指甲与牙齿：在特定情况下，如无法获得其他更优样本时，指甲和牙齿也可作为替代样本。它们含有角蛋白和少量DNA，虽不如上述样本常见，但在紧急或特殊情境下仍有其应用价值。不过，从这些样本中提取DNA的难度较大，成功率相对较低，通常作为补充或辅助验证手段。
羊水与绒毛：对于孕期亲子鉴定，羊水穿刺或绒毛取样是两种常用方法。这些样本直接来源于胎儿，能够提给最直接的遗传信息。然而，这两种方法均属于侵入性检查，存在一定的流产风险，仅在特定医疗指征下由专业医生操作执行。
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